有机肥大家应该了解，其本质就是农家肥，包括人畜粪尿、作物秸秆、草木灰、泥肥、绿肥。而“生物有机肥”是以禽畜粪便、农作物秸秆、生活垃圾等为基质，复合而成的兼具有机肥和微生物功效的肥料，因此生物有机肥比有机肥多了改良土壤的有益微生物(固氮菌、酵母菌、光合菌等)。

　　微生物菌肥又俗称微生物菌剂，它是利用多孔的物质来吸附菌体而制成的活菌制剂，它里面含有大量可繁殖的微生物，其强调的是“菌”，里面一般不含有有机物。

　　特别注意：微生物菌肥(微生物菌剂)一般不直接为农作物提供营养元素，主要起间接营养的作用。所谓的间接营养是指其中的有益微生物能促进腐殖质的形成和分解、养分的释放、氮素的固定等，其次这些微生物还能产生糖类物质，因此微生物菌肥虽然不直接提供营养，但是却可以明显的提高土壤的肥力。生物有机肥里面不仅含有“有机质”，而且还含有微生物，因此生物有机肥也可以理解成是有机肥和微生物菌肥的复配产品。